ספר יוסיפון הינו ספר המתאר את ההיסטוריה של עם ישראל בתקופת בית שני עד למרד הגדול שבסופו נחרב בית המקדש. בנוגע למידת אמינותו של הספר התקיימו פולמוסים רבים.
הרבה קורין היוסיפון – ונמצא בבית כו"כ [=כמה וכמה].
הדעות ע"ד [יוסיפון] ומחברו – הפוכות ומן הקצה אל הקצה. ובכלל: רוב המבקרים החפשים משמיצים אותו ורוב היראים משבחים אותו (ראה צמח דוד, סדה"ד ועוד), ומתרצים מש"כ בשבח הרומאים וכו' – מפני שהי' בשבי שלהם וחשוב בעיניהם ורצה לבטל גזירות על היהודים וכיו"ב.
בדבריו מציין הרבי לספר "צמח דוד" שכתב הרב דוד גנז ובו מסכם את ידיעות בני זמנו (המאה ה-16) על ספר יוסיפון:
"יוסף בן גריון הכהן, ממיוחסי ושועי הכהנים שבירושלים ומשוח מלחמה. הוא חבר את ספרו אחר חורבן הבית ואם מקצת דבריו נראים קצת כסותרין את דברי רז"ל … תדע מאחר שזה האיש היה גדול בחכמה ובתבונה איש צדיק וישר והוא קודם בזמן מחכמי הגמרא כמה מאות שנה. ראה את כל הנעשה בימיו, על כן אין אנו מחזיקים אותו לסופר בלתי נאמן ומפני זה אנשים חכמים וידועים הלמו יחד סיפוריו וסיפורי חז"ל באופן שאין דבריהם יהיו סותרים זה לזה." ("צמח דוד", חלק א', סימן תתכ"ט)